В последнее время участились вирусы, которые правят реестр и не дают отображать скрытые файлы и папки , а точнее при отметке пункта "Показывать скрытые папки и файлы" ничего не происходит.
Выход есть:
REGEDIT4
[HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced]
"Hidden"=dword:00000001
[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Explorer\Advanced\Folder\Hidden\SHOWALL]
"CheckedValue"=dword:00000001
Сохраните этот текст в файл hid.reg и щёлкните два раза по нему мышкой и согласитесь с внесение изменений в реестр.
После этого Всё должно будет заработать.
Соответственно если Вам нужно наоборот запретить показ срытых файлов замените значения 00000001 на 00000000
PS
Удалить вирусню из командной строки можно например так:
Del C:\Autorun.* /f/a/s/q